科學(xué)家在線蟲(chóng)中發(fā)現(xiàn)了一種意想不到的基因
秀麗隱桿線蟲(chóng)的人類(lèi)同源體為研究肌萎縮性側(cè)索硬化癥和阿爾茨海默病等疾病打開(kāi)了新的研究窗口。
MDI 生物實(shí)驗(yàn)室
11月7日消息
近日發(fā)表在《自然-通訊》(Nature Communications)上的新的同行評(píng)議研究中,Emily Spaulding 博士、Dustin Updike 博士。在微小透明的線蟲(chóng)(秀麗隱桿線蟲(chóng))身上發(fā)現(xiàn)了一種著名的人類(lèi)蛋白質(zhì)的同源物核仁素(Nucleolin)。
研究于2022年11月3日發(fā)表在《Nature Communications》(最新影響因子:17.694)雜志上
核仁素與人類(lèi)神經(jīng)退行性疾病和癌癥有關(guān)。但這項(xiàng)新發(fā)現(xiàn)挑戰(zhàn)了最近關(guān)于細(xì)胞核內(nèi)部結(jié)構(gòu)在這種疾病中可能扮演的角色的理論,并為研究核仁素的功能以及它如何導(dǎo)致疾病提供了一個(gè)強(qiáng)大的新工具。
“核仁素是一種在許多動(dòng)物、植物和真菌中都存在的多功能蛋白質(zhì),但以前被認(rèn)為在線蟲(chóng)中不存在,” Spaulding 說(shuō),她是 MDI 生物實(shí)驗(yàn)室(Mount Desert Island Biological Laboratory,MDIBL)Updike 實(shí)驗(yàn)室的博士后,“它還與家族性肌萎縮性側(cè)索硬化癥(ALS)和阿爾茨海默。ˋD)有關(guān),而整體核仁功能障礙與神經(jīng)退行性變有關(guān)。”
Emily Spaulding
他們對(duì)核仁素同源物(命名為 NUCL-1)的鑒定將秀麗隱桿線蟲(chóng)確立為核仁素的神經(jīng)元功能和相關(guān)神經(jīng)退行性變的遺傳學(xué)的新發(fā)現(xiàn)平臺(tái)。
核仁素主要存在于核仁中,核仁是細(xì)胞核內(nèi)核糖體組裝的工廠。與細(xì)胞內(nèi)許多其他膜結(jié)合的細(xì)胞器不同,核仁的行為像一個(gè)大液滴,也稱(chēng)為凝析液。
凝析液是通過(guò)液-液相分離(phase separation)形成的。有人想象熔巖燈內(nèi)部會(huì)形成不同密度的斑點(diǎn),但這究竟是如何在活細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)的尚不清楚。Spulding 和 Updike 的研究表明,在秀麗隱桿線蟲(chóng)的核仁中,NUCL-1 是相分離所必需的。
令人驚訝的是,破壞種系的相分離對(duì)健康或生育沒(méi)有影響!
因?yàn)?strong>線蟲(chóng)特別適合活體顯微鏡,可以近距離觀察活體動(dòng)物內(nèi)部的內(nèi)源性蛋白質(zhì),所以這一發(fā)現(xiàn)可能會(huì)改變科學(xué)家對(duì)凝析物(如核仁)特征的看法。
“秀麗隱桿線蟲(chóng)的透明性使我們能夠進(jìn)行超分辨率成像,這使我們能夠看到活體動(dòng)物的核仁亞結(jié)構(gòu),” Spulding 說(shuō),“我從未在其他地方見(jiàn)過(guò)這樣的圖像。”
Spulding 把核仁比作棒棒糖!八鼜睦锏酵舛际層層疊疊的,”她說(shuō),“有些蛋白質(zhì)定位在最內(nèi)層,有些蛋白質(zhì)定位在最外層。每一層都被認(rèn)為代表核糖體生物生成的一個(gè)步驟!
左圖是一種活的野生型秀麗隱桿線蟲(chóng)的核仁的超分辨率圖像,顯示了內(nèi)部凝析物組織良好的結(jié)構(gòu)。右圖中,當(dāng)一種新發(fā)現(xiàn)的編碼基因 NUCL-1在突變線蟲(chóng)中被破壞時(shí),結(jié)構(gòu)就會(huì)崩潰。與人們對(duì)核仁亞結(jié)構(gòu)功能的一些認(rèn)識(shí)相反,野生型和突變型線蟲(chóng)都是健康的,發(fā)育正常,并保持生育能力
凝析液子結(jié)構(gòu)的生物學(xué)意義尚存疑問(wèn),最近的觀點(diǎn)認(rèn)為,核仁的精確的、分層的空間組織對(duì)核糖體的產(chǎn)生至關(guān)重要。但是 MDIBL 的科學(xué)家們觀察到,盡管移除轉(zhuǎn)基因秀麗隱桿線蟲(chóng) NUCL-1 的一個(gè)關(guān)鍵蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域,破壞了生殖細(xì)胞內(nèi)的核仁結(jié)構(gòu),但突變線蟲(chóng)仍然正常發(fā)育,并產(chǎn)生正常的后代。
她說(shuō):“我們注意到,當(dāng)我們?nèi)サ艉巳实膮^(qū)域時(shí),核仁失去了它美麗的子結(jié)構(gòu),但線蟲(chóng)完全沒(méi)事。這是一個(gè)意外,這暗示著這種精確的分層組織對(duì)核仁功能并不像我們想象的那么重要。這可能對(duì)理解 ALS 或 AD 很重要,人們認(rèn)為廣泛的相分離中斷是導(dǎo)致疾病的原因!
Updike 說(shuō):“這將是一件真正影響相分離領(lǐng)域的事情,因?yàn)樵S多得出的結(jié)論可能是不正確的。這些結(jié)果應(yīng)該會(huì)引起廣泛的興趣,并將在相分離、核仁結(jié)構(gòu)和功能以及核仁相關(guān)人類(lèi)疾病等領(lǐng)域引發(fā)新的研究途徑!
Spaulding 是 2022 年美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院(NIH)神經(jīng)科學(xué)杰出學(xué)者獎(jiǎng)的獲獎(jiǎng)?wù)摺?/p>
創(chuàng)立于1898年的MDI生物實(shí)驗(yàn)室
(一個(gè)獨(dú)立的非營(yíng)利性生物醫(yī)學(xué)研究機(jī)構(gòu))
參考文獻(xiàn)
Source:MDI Biological Laboratory
Scientists reveal an unexpected gene in transparent worms
Reference:
Spaulding, E.L., Feidler, A.M., Cook, L.A. et al. RG/RGG repeats in the C. elegans homologs of Nucleolin and GAR1 contribute to sub-nucleolar phase separation. Nat Commun 13, 6585 (2022). https://doi.org/10.1038/s41467-022-34225-5
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原文標(biāo)題 : 科學(xué)家在線蟲(chóng)中發(fā)現(xiàn)了一種意想不到的基因

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