6月17日，我們邀請(qǐng)了吉林省蒲川生物醫(yī)藥有限公司的研發(fā)總監(jiān)－－宿曉云博士給大家詳細(xì)講解了《高效高通量基因分析系統(tǒng)在醫(yī)藥研發(fā)中的應(yīng)用》的線(xiàn)上課程，課程主要內(nèi)容回顧：

藥物研發(fā)中有效成分篩選驗(yàn)證是長(zhǎng)時(shí)間、高成本、高風(fēng)險(xiǎn)的過(guò)程，在藥物研發(fā)成本中占極大比例。本課程介紹了一套新型的高效高通量基因分析系統(tǒng)，從基因水平進(jìn)行藥效作用預(yù)測(cè)，同時(shí)分析藥物可能作用機(jī)制，可以極大縮短篩選時(shí)間，降低成本，節(jié)約樣本。此外相對(duì)于針對(duì)某一特定靶點(diǎn)進(jìn)行藥物篩選，本系統(tǒng)可對(duì)未知作用成分進(jìn)行分析預(yù)測(cè)，可對(duì)已有分子庫(kù)進(jìn)行充分篩選，“變廢為寶”；也可以實(shí)現(xiàn)已有藥物的二次開(kāi)發(fā)，對(duì)于從事醫(yī)藥研究的工作者具有極大幫助。

課程反響熱烈，會(huì)議中及會(huì)后交流群中，大家提問(wèn)的一些問(wèn)題，宿老師也一一做了回答，感謝各位老師的積極互動(dòng)，現(xiàn)將問(wèn)答分享如下，供各位參考、交流。

Q：這是一種器械嗎？

A：不是。這是一套系統(tǒng)，包括檢測(cè)系統(tǒng)，數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)和檢測(cè)分析數(shù)據(jù)組成的數(shù)據(jù)庫(kù)。

Q：藥物的檢測(cè)濃度如何確定？

A：任何實(shí)驗(yàn)之前都要對(duì)藥物濃度進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn)篩選，基因檢測(cè)濃度可選用藥物的IC50。對(duì)于隨濃度變化藥效作用變化較大的藥要設(shè)定多個(gè)濃度梯度，選擇需要的藥效濃度。

Q：是不是就是轉(zhuǎn)錄組學(xué)在藥物篩選領(lǐng)域的應(yīng)用？

A：基本原理是基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)對(duì)藥物進(jìn)行篩選，但需要大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合信息學(xué)分析

Q：轉(zhuǎn)錄組測(cè)什么細(xì)胞系的？細(xì)胞系選擇依據(jù)？

A：要根據(jù)對(duì)藥物作用的初步判斷進(jìn)行選擇，例如作用于呼吸系統(tǒng)、消化系統(tǒng)或者神經(jīng)系統(tǒng)，針對(duì)炎癥、腫瘤或者正常組織，來(lái)選擇細(xì)胞模型。

Q：轉(zhuǎn)錄組的表達(dá)隨時(shí)間變化較大，檢測(cè)的時(shí)間節(jié)點(diǎn)是怎么選擇？

A：常用的時(shí)間點(diǎn)通常是6h，24h和48h，在篩選藥物IC50的時(shí)候可分別測(cè)試這些時(shí)間點(diǎn)的IC50，選定濃度同時(shí)選擇對(duì)應(yīng)的時(shí)間點(diǎn)。對(duì)于對(duì)時(shí)間變化藥效呈規(guī)律性變化的藥物，我們通常采用實(shí)時(shí)無(wú)標(biāo)記細(xì)胞分析系統(tǒng)每15分鐘記錄一次細(xì)胞狀態(tài)，根據(jù)72h細(xì)胞時(shí)效曲線(xiàn)選擇時(shí)間節(jié)點(diǎn)。

Q：老師發(fā)現(xiàn)的這么多藥物有進(jìn)入臨床開(kāi)發(fā)的嗎，這么多領(lǐng)域，看起來(lái)非常激動(dòng)人心啊！

A：現(xiàn)在還都在臨床前階段，因?yàn)樗幬锏拈_(kāi)發(fā)周期比較長(zhǎng)，為了合理安排開(kāi)發(fā)周期我們還篩選了一些功效性保健食品和功效性化妝品成分，因?yàn)槭且运幬镅邪l(fā)思路篩選的功效成分，所以效果都比較明顯，現(xiàn)在已經(jīng)有部分產(chǎn)品通過(guò)申報(bào)開(kāi)始上市了。而我們也可以通過(guò)周期較短的產(chǎn)品提供資金繼續(xù)支持藥品的研發(fā)。

Q：RNA轉(zhuǎn)cDNA的偏差如何消除？

A：高效高通量系統(tǒng)中樣本的基因提取、轉(zhuǎn)錄、擴(kuò)增等操作都不是手動(dòng)一個(gè)個(gè)進(jìn)行的，而是采用全自動(dòng)液體工作站整批進(jìn)行，以減少人為操作誤差。逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程oligo dT是固定在采用孔板的板底的，這樣樣本加入后mRNA可直接被提取固定在板底，每次只需把反應(yīng)液直接棄掉更換新的反應(yīng)體系，反應(yīng)就可以在板底完成，所以孔間也就是樣品間差異非常小

Q：不同的細(xì)胞系轉(zhuǎn)錄水平不一樣，怎么把不同細(xì)胞系中的數(shù)據(jù)整合起來(lái)？

A：在做藥效評(píng)價(jià)藥物篩選的時(shí)候，盡量保證單變量，不同藥物、不同濃度、不同時(shí)間等，細(xì)胞系多選擇同一細(xì)胞系。如果需要在不同細(xì)胞類(lèi)型做比較，要將包括陰性對(duì)照、陽(yáng)性對(duì)照、不同藥物等的全部樣本在另一細(xì)胞系上全部重復(fù)，然后比較藥物作用后數(shù)據(jù)的變化情況。

    吉林省蒲川生物醫(yī)藥有限公司成立于2014年，注冊(cè)資本4000萬(wàn)元，是致力于藥效學(xué)基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)建設(shè)及新藥開(kāi)發(fā)、中藥現(xiàn)代化以及功效性化妝品、保健品、食品等成果應(yīng)用的高新技術(shù)企業(yè)，省級(jí)工程實(shí)驗(yàn)室、省級(jí)雙創(chuàng)平臺(tái)。

公司聚集眾多高水平人才，經(jīng)過(guò)多年努力，成功開(kāi)發(fā)具有國(guó)際先進(jìn)水平及自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的“高效高通量基因檢測(cè)分析系統(tǒng)”，建立了天然產(chǎn)物藥效學(xué)基因表達(dá)大數(shù)據(jù)庫(kù)，以此數(shù)據(jù)庫(kù)為基礎(chǔ)，針對(duì)人體生物學(xué)關(guān)鍵基因靶點(diǎn)開(kāi)展新藥研發(fā)、藥物二次開(kāi)發(fā)、中藥現(xiàn)代化研究及功能性化妝品、保健品、食品等開(kāi)發(fā)，已取得數(shù)十項(xiàng)成果。該系統(tǒng)具有成本低、效率高等特點(diǎn)，可大大縮短研發(fā)周期，降低研發(fā)成本。

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